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    Biomarqueurs du vieillissement et méthylation de l'ADN dans la sénescence cellulaire

    Biomarkers of Aging: The Science Tracking Your Biological

    Introduction

    Comprendre les biomarqueurs du vieillissement est essentiel pour appréhender le processus de vieillissement et élaborer des stratégies efficaces visant à favoriser la durée de vie en bonne santé et la longévité. Ces biomarqueurs fournissent des indicateurs mesurables de l'âge biologique, permettant aux chercheurs et aux cliniciens d'évaluer dans quelle mesure l'organisme fonctionne au-delà de l'âge chronologique.

    L'évaluation du processus de vieillissement sous plusieurs angles offre une vision globale, allant de marqueurs moléculaires comme la longueur des télomères et les horloges de méthylation de l'ADN à des indicateurs phénotypiques tels que la force de préhension et la vitesse de marche. Cet article examine les biomarqueurs du vieillissement pertinents, notamment les marqueurs moléculaires, phénotypiques, diagnostiques et épigénétiques, afin de comprendre, prédire et potentiellement modifier l'évolution du vieillissement.

    Les biomarqueurs du vieillissement peuvent reposer sur des données phénotypiques (fonction physique et anthropométrie) et des données moléculaires (par exemple, la longueur des télomères, les horloges épigénétiques et les biomarqueurs sanguins de laboratoire). Les biomarqueurs de laboratoire de routine sont généralement mesurés dans des laboratoires cliniques accrédités selon des méthodes standardisées. Une combinaison complète de biomarqueurs de laboratoire, épigénétiques, non épigénétiques, de capacité physique, de fonction organique, ainsi que de marqueurs de sénescence, est très probablement la clé pour formuler un biomarqueur composite valide du vieillissement.

    Cependant, un biomarqueur standardisé (composite) du vieillissement qui mesure spécifiquement tous les aspects importants du vieillissement reste encore à établir et à valider pleinement.

    Biomarkers of Aging: The Science Tracking Your Biological

    Biomarqueurs moléculaires du vieillissement

    Les biomarqueurs moléculaires du vieillissement reposent sur des analyses à haut débit, dont la valeur prédictive est souvent inconnue et qui sont principalement utilisées dans un contexte de recherche uniquement. Il s'agit pour la plupart de biomarqueurs dits à l'échelle du génome entier (« omiques »).

    Catégorie de biomarqueur

    Sous-catégorie de biomarqueur

    Biomarqueur

    Tendance avec l'âge

    ADN et chromosome

    Télomère

    Longueur des télomères leucocytaires

    Diminution

    ADN et chromosome

    Réparation de l'ADN

    Immunohistochimie γ-H2A.X

    Augmentation

    ADN et chromosome

    Modification épigénétique

    Méthylation de l'ADN

    Hypométhylation globale et hyperméthylation locale

    Transcriptome de l'ARN

    Profils transcriptomiques

    Hétérogénéité de CD38 dans les cellules T CD4+ & CD27+



    Diminution

    Transcriptome ARN

    Hétérogénéité de CD197 dans les cellules T CD4+ & CD25+

    Augmentation

    Transcriptome ARN

    microARN circulants 

    (miRNAs)

    miR-34a, miR-21, miR-126-3p

    Augmentation

    Transcriptome ARN

    miR-151a-3p, miR-181a-5p, miR-1248

    Diminution

    Transcriptome ARN

    Longs ARN non codants

    MIR31HG

    Augmentation de la sénescence cellulaire

    Transcriptome ARN

    AK156230

    Diminution de la sénescence cellulaire

    Transcriptome ARN

    Meg3

    Augmentation de la sénescence cellulaire

    Métabolisme

    Détection des nutriments

    Hormone de croissance et insuline/facteur de croissance 1 de type insulinique (IGF-1)

    Diminution

    Métabolisme

    Cible mécanistique de la rapamycine (mTOR) et pS6RP

    Augmentation

    Métabolisme

    NAD+, SIRT1, SIRT2, SIRT3, SIRT6

    Diminution

    Métabolisme

    Métabolisme des protéines

    La carbamylation des protéines, comme le taux d’homocitrulline

    Augmentation

    Métabolisme

    Produits finaux de glycation avancée et N-glycanes

    Augmentation

    Métabolisme

    Métabolisme lipidique

    Triglycérides

    Augmentation

    Stress oxydatif et mitochondries

    o-tyrosine, 3-chlorotyrosine, 3-nitrotyrosine, 8-iso prostaglandin F2α, 8-hydroxy-2′-deoxyguanosine, 8-hydroxyguanosine

    Augmentation

    Sénescence cellulaire

    β-galactosidase associée à la sénescence

    Augmentation de la sénescence cellulaire

    Sénescence cellulaire

    p16INK4A

    Augmentation de la sénescence cellulaire

    Inflammation et communication intercellulaire

    Phénotype sécrétoire associé à la sénescence

    Augmentation

    Tableau: Biomarqueurs moléculaires du vieillissement.

    Source: Xia, X. & Chen, W. & McDermott, J. & Han, J. (2017). Biomarqueurs moléculaires et phénotypiques du vieillissement. F1000Research 6: 860.

    Test sanguin GlycanAge

    GlycanAge est un test sanguin à réaliser à domicile qui analyse les glycanes (des sucres qui recouvrent les cellules) dans l’organisme afin de déterminer votre âge biologique. Ils examinent la composition du glycome des IgG (qui régule l’inflammation chronique de bas grade et favorise le vieillissement). La technologie GlycanAge va au-delà des tests d’âge biologique existants en intégrant les aspects génétiques, épigénétiques et environnementaux du vieillissement.(1)

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    Biomarqueurs du vieillissement : la science qui suit votre âge biologique

    Biomarqueurs phénotypiques du vieillissement

    Les biomarqueurs phénotypiques non moléculaires décrivent les fonctions physiologiques du corps, en particulier les capacités physiques et la fonction des organes. Le vieillissement entraîne des modifications aux niveaux structurel, fonctionnel et moléculaire de la plupart des cellules, tissus et systèmes d’organes. La perte progressive et graduelle des fonctions de maintenance des tissus est particulière au vieillissement.(2)

    Catégorie de biomarqueur

    Biomarqueur

    Tendance avec l’âge

    Fonction physique

    Vitesse de marche

    Diminution

    Lever de chaise

    Diminution

    Équilibre en station debout

    Diminution

    Force de préhension

    Diminution

    Anthropométrie

    Masse musculaire

    Diminution

    Indice de masse corporelle

    Augmentation

    Tour de taille

    Augmentation

    Caractéristiques faciales

    Largeur de la bouche

    Augmentation

    Largeur du nez

    Augmentation

    Distance bouche-nez

    Augmentation

    Inclinaison du coin de l’œil

    Diminution

    Tableau : Biomarqueurs phénotypiques du vieillissement.

    Source : Xia, X. & Chen, W. & McDermott, J. & Han, J. (2017). Molecular and phenotypic biomarkers of aging. F1000Research 6: 860.

    Biomarqueurs diagnostiques du vieillissement

    Les biomarqueurs diagnostiques aident à diagnostiquer, confirmer ou exclure une maladie. Ils peuvent être pronostiques de décès (mortalité) ou de l’apparition et de la progression d’une maladie (morbidité). Les biomarqueurs diagnostiques peuvent également être prédictifs pour surveiller le succès ou l’échec d’un traitement. Ces biomarqueurs sont aussi utilisés en santé préventive pour prédire et, plus important encore, prévenir l’apparition d’une maladie.

    Biomarqueur potentiel

    Processus lié à l’âge

    Résultat possiblement lié au vieillissement

    Lymphocytes/GB (dans la numération formule sanguine complète) [PA]

    Inflammation et maladies auto-immunes

    Chroniquement abaissé ou élevé

    Insuline

    Résistance à l’insuline & état diabétique

    Chroniquement élevé

    Glucose & glucose à jeun

    Résistance à l’insuline & diabète

    Chroniquement élevé

    Protéine C-réactive (CRP/hs-CRP)  [IA & PA]

    Inflammation, cancer & maladie cardiovasculaire

    Chroniquement élevé

    Cholestérol

    Maladie cardiovasculaire

    Chroniquement abaissé ou élevé

    Albumine [PA]

    Dysfonction rénale et hépatique

    Abaissé

    IL-6 [PA]

    Inflammation

    Élevé

    Facteur de nécrose tumorale alpha (TNF-α)

    Inflammation et cancer

    Élevé

    Hémoglobine

    Anémie et autres troubles hématopoïétiques

    Chroniquement abaissée ou élevée

    Facteur de croissance analogue à l’insuline 1 (IGF-1)

    Maladie métabolique

    Élevé

    Cholestérol LDL

    Maladie cardiovasculaire

    Chroniquement abaissé ou élevé

    Triglycérides

    Maladie cardiovasculaire

    Chroniquement élevé

    Cholestérol HDL

    Maladie cardiovasculaire

    Chroniquement abaissé

    Créatinine [PA]

    Dysfonction rénale

    Élevé

    Monocytes

    Inflammation

    Chroniquement élevé

    Hémoglobine glyquée (HbA1C)

    Résistance à l’insuline & diabète

    Élevé

    Cystatine C

    Dysfonction rénale

    Élevé

    NT-proBNP

    Insuffisance cardiaque

    Élevé

    Phosphatase alcaline [PA]

    Lésion hépatique & trouble osseux

    Chroniquement élevé

    Hématocrite/GR (dans la numération formule sanguine)

    Anémie

    Chroniquement diminué ou élevé

    D-dimère

    État d’hypercoagulabilité

    Élevé

    IL-8 [IA]

    Inflammation

    Élevé

    Inhibiteur de l’activateur du plasminogène-1 (PAI1)

    État prothrombotique dans le cancer et d’autres phases aiguës

    Chroniquement élevé

    Bilirubine

    Dysfonction hépatique

    Chroniquement élevé

    Urée

    Dysfonction rénale

    Chroniquement élevé

    IL-15

    Inflammation

    Chroniquement élevé

    VGM (dans la numération formule sanguine)

    Anémie et autres troubles hématopoïétiques

    Chroniquement diminué ou élevé

    CCMH (dans la numération formule sanguine)

    Anémie et autres troubles hématopoïétiques

    Chroniquement diminué ou élevé

    Rapport CD4/CD8

    Déficit immunitaire et auto-immunité

    Chroniquement diminué

    Peptide C (préférable à l’insuline)

    Résistance à l’insuline & état diabétique

    Chroniquement élevé

    IL1-β

    Inflammation

    Chroniquement élevé

    Tableau: Marqueurs sanguins potentiels de laboratoire de routine.

    Source adaptée de: Hartmann, A. et al. (2021). Ranking biomarkers of aging by citation profiling and effort scoring. Frontiers in Genetics 12: 797.

    Biomarqueurs épigénétiques de laboratoire

    L’épigénome est un système dynamique qui joue un rôle majeur dans le vieillissement. La méthylation de l’ADN et les modifications des histones évoluent avec l’âge chronologique et avec les maladies chroniques au fil du temps.(3) Le vieillissement est associé à une hypométhylation générale et à une hyperméthylation locale. Pour analyser correctement la méthylation de l’ADN, diverses « horloges épigénétiques » ont été développées (telles que l’horloge de Horvath, l’horloge de Weidner et l’horloge de Hannum).(4)

    Biomarqueur potentiel

    Matériel & méthode

    Prédiction

    Méthylation de l’ADN et horloges du vieillissement :

    Horloge de Horvath

    ADN (analyse de méthylation)

    Âge chronologique

    Horloge de Hannum

    ADN (analyse de la méthylation)

    Âge chronologique

    DNAm GrimAge

    ADN (analyse de la méthylation)

    Âge biologique

    DNAm PhenoAge

    ADN (analyse de la méthylation)

    Âge biologique

    Horloge de Weidner

    ADN (analyse de la méthylation)

    Âge chronologique

    EpiTOC

    ADN (analyse de la méthylation)

    Âge biologique

    miRNA (microARN)

    ARN (séquençage de nouvelle génération, puces à ADN)

    Morbidité, mortalité

    Profils d’expression des ARN non codants

    ARN (séquençage)

    Âge chronologique

    exRNA (ARN extracellulaire)

    Sang/plasma (séquençage de nouvelle génération)

    Morbidité, mortalité

    Modifications des histones :

    Méthylation de H4K20

    Sang/plasma (méthodes multiples)

    Stress cellulaire

    Acétylation de H4K16

    Sang/plasma (méthodes multiples)

    Stress cellulaire

    Méthylation de H3K4

    Extrait protéique (méthodes multiples)

    Stress cellulaire

    Méthylation de H3K9

    ADN tissulaire (méthodes multiples)

    Stress cellulaire

    Méthylation de H3K27

    ADN tissulaire (méthodes multiples)

    Stress cellulaire

    Remodelage de la chromatine

    ADN (tests de remodelage de la chromatine)

    Âge chronologique

    Tableau : Biomarqueurs épigénétiques potentiels.

    Source adaptée de : Hartmann, A. et al. (2021). Ranking biomarkers of aging by citation profiling and effort scoring. Frontiers in Genetics 12: 797.

    En résumé : Le vieillissement est un processus extrêmement complexe et hautement individuel, qui n’est pas encore entièrement compris. Par conséquent, de nombreux biomarqueurs liés au vieillissement ne font peut-être qu’en effleurer la surface et n’offrir qu’un point de vue sous un angle spécifique sur ce qui relève du vieillissement. Ainsi, une combinaison de tests de laboratoire de routine à large spectre, de tests épigénétiques, de biomarqueurs moléculaires et de marqueurs phénotypiques peut constituer la meilleure solution pour évaluer de manière globale le processus de vieillissement d’un individu.

    Biomarkers of Aging: The Science Tracking Your Biological

    DNAm PhenoAge - Un test de biomarqueur du vieillissement biologique facile à réaliser

    Une étude de Levine et al. 2018 a introduit une approche novatrice pour développer un biomarqueur épigénétique du vieillissement à l’aide de la méthylation de l’ADN (DNAm). Ce nouveau biomarqueur, DNAm PhenoAge, représente une avancée importante par rapport aux marqueurs précédents, car il se concentre sur l’âge phénotypique plutôt que sur l’âge chronologique, ce qui améliore la prédiction de l’espérance de vie en bonne santé et des risques de mortalité. DNAm PhenoAge démontre une capacité remarquable à prédire un large éventail d’issues de morbidité et de mortalité, en particulier les maladies cardiovasculaires et coronariennes. Contrairement aux biomarqueurs antérieurs, DNAm PhenoAge étend son pouvoir prédictif au-delà des échantillons sanguins à d’autres tissus.(4)

    La nature modérément héritable du biomarqueur est liée à des marqueurs d’immunosénescence, à des processus pro-inflammatoires et à divers facteurs associés au vieillissement. DNAm PhenoAge surpasse les biomarqueurs épigénétiques antérieurs grâce à la sélection spécifique de sites CpG optimisés pour prédire la dysrégulation physiologique. Bien qu’il ne soit pas destiné à remplacer les biomarqueurs cliniques dans les décisions médicales, DNAm PhenoAge offre des informations précieuses sur les mécanismes du vieillissement et sur l’évaluation des interventions liées au vieillissement.

    En outre, la capacité du biomarqueur à différencier le vieillissement préclinique et les vitesses de vieillissement spécifiques aux cellules et aux tissus en fait un outil précieux pour diverses études liées à l’âge. L’étude examine les associations entre DNAm PhenoAge et les voies transcriptionnelles, révélant des liens avec les voies pro-inflammatoires, de l’interféron et de réparation des dommages. L’héritabilité de DNAm PhenoAge est possible, ce qui nécessite des recherches supplémentaires pour en élucider l’architecture génétique.

    Fait intéressant, DNAm PhenoAge reste relativement stable au fil du temps, ce qui soulève des questions sur l’influence de la génétique et la persistance des caractéristiques sociales et comportementales. Les applications potentielles du biomarqueur incluent l’évaluation des interventions sur le vieillissement et l’obtention d’informations sur la dynamique du processus de vieillissement. DNAm PhenoAge apparaît comme un biomarqueur prometteur, avec des implications pour la recherche fondamentale sur les mécanismes du vieillissement et pour des applications translationnelles pratiques.

    La liste des biomarqueurs inclus dans le test DNAm PhenoAge :

    • Albumine (g/L) – foie
    • Créatinine (μmol/L) – rein
    • Glucose, sérum (mmol/L) – métabolique
    • Protéine C-réactive (mg/dL) – inflammation
    • Volume globulaire moyen (fL) – immunitaire
    • Largeur de distribution des globules rouges (%) – immunitaire
    • Phosphatase alcaline (U/L) – foie
    • Numération des globules blancs (1000 cellules/μL) - immunitaire

    Calculez votre DNAm PhenoAge ici (si vous disposez de tous les biomarqueurs testés mentionnés ci-dessus).

    Conclusion

    Le vieillissement est un processus multifactoriel et hautement individualisé, influencé par des changements moléculaires, cellulaires et physiologiques. Les biomarqueurs du vieillissement, allant de la longueur des télomères et des profils de méthylation de l’ADN aux mesures de la performance physique et de la fonction des organes, fournissent un cadre précieux pour étudier et gérer cette complexité. Malgré des avancées importantes, aucun biomarqueur standardisé unique ne capture pleinement toutes les dimensions du vieillissement, ce qui souligne la nécessité d’approches intégratives combinant plusieurs types de biomarqueurs. Des outils tels que DNAm PhenoAge représentent une étape prometteuse, offrant des informations sur les mécanismes biologiques du vieillissement et sur les interventions potentielles. Avec davantage de développement, de recherche scientifique et d’expérience, ces biomarqueurs continueront de servir d’instruments essentiels pour faire progresser la médecine de précision, promouvoir un vieillissement en bonne santé et optimiser les stratégies de longévité.

    Références scientifiques :

    1. Dall’Olio, F., & Malagolini, N. (2021). Modifications de la glycosylation de l’immunoglobuline G dans le vieillissement et d’autres affections inflammatoires. Antibody Glycosylation, 303-340.
    2. López-Otín, C. & Blasco, M. & Partridge, L. & Serrano, M. & Kroemer, G. (2013). Les caractéristiques du vieillissement. Cell 153 (6): 1194–1217.
    3. Ashapkin, V. & Kutueva, L. & Vanyushin, B. (2019). Horloge épigénétique: simplement un marqueur pratique ou un moteur actif du vieillissement? Reviews on Biomarker Studies in Aging and Anti-Aging Research 175–206.
    4. Levine, M. et al. (2018). Un biomarqueur épigénétique du vieillissement pour la durée de vie et la durée de vie en bonne santé. Aging 10 (4): 573–591.

    Références supplémentaires pour les tableaux et les biomarqueurs:

    • Xia, X. & Chen, W. & McDermott, J. & Han, J. (2017). Biomarqueurs moléculaires et phénotypiques du vieillissement. F1000Research 6: 860.
    • Hartmann, A. et al. (2021). Classement des biomarqueurs du vieillissement selon le profilage des citations et un système de notation de l'effort. Frontiers in Genetics 12: 797. 

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